diff --git a/README.md b/README.md
index cc235d7..2c75d25 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -147,12 +147,15 @@ var a = (function () { return 'a'; }).call(global),
 
 ##### Опция `-i, --istanbul`
 
-Опция позволяет указать имя модуля, для которого предполагается запуск [istanbul](https://github.com/gotwarlost/istanbul).
-В результирующем файле у каждого модуля, который необходим для указанного модуля
-будет добавлен комментарий, исключающий его из оценки покрытия тестами.
+Опция позволяет перечислить имена модулей, для которых предполагается запуск [istanbul](https://github.com/gotwarlost/istanbul).
+Для всех остальных модулей будет добавлен комментарий, исключающий их из оценки покрытия тестами.
 
     ./node_modules/.bin/definer -i b all.js
 
+Возможно указание нескольких модулей через запятую.
+
+    ./node_modules/.bin/definer -i b,c all.js
+
 По умолчанию комментарии не добавляются, поскольку запуск оценки покрытия тестами не предполагается.
 
 ##### Опция `-v, --verbose`
diff --git a/cli.js b/cli.js
index 6107111..1f1ad49 100644
--- a/cli.js
+++ b/cli.js
@@ -12,11 +12,13 @@ const path = require('path'),
 commander
     .version('0.0.4')
     .usage('[options] <file>')
-    .option('-d, --directory <path1,path2>', 'directory of modules, comma delimited', '.')
+    .option('-d, --directory <path1,pathN>', 'directory of modules, comma delimited', '.')
     .option('-m, --module <name>', 'target module name')
-    .option('-i, --istanbul <name>', 'target module name to coverage by istanbul')
+    .option('-i, --istanbul <name1,nameN>', 'names of modules to coverage by istanbul, comma delimited',
+        function(modules) { return modules.split(','); })
     .option('-p, --postfix <postfix>', 'postfix to find files')
-    .option('-v, --verbose <modes>', 'l - log, i - info, w - warn, e - error', function(modes) { return modes.split(''); })
+    .option('-v, --verbose <modes>', 'l - log, i - info, w - warn, e - error',
+        function(modes) { return modes.split(''); })
     .option('-c, --config <file>', 'json format config', defaultConfigFile)
     .parse(process.argv);
 
diff --git a/maker.js b/maker.js
index 63f3b83..3e91707 100644
--- a/maker.js
+++ b/maker.js
@@ -77,7 +77,7 @@ function Maker(options) {
      * @type {{
      * directory: String|String[],
      * module: String|boolean,
-     * istanbul: String|boolean,
+     * istanbul: String|String[]|boolean,
      * postfix: String,
      * verbose: Array,
      * clean: Object,
@@ -109,6 +109,14 @@ function Maker(options) {
  */
 Maker.cacheFiles = {};
 
+/**
+ * Комментарий для указания istanbul игнорировать блоки кода
+ * @private
+ * @constant
+ * @type {String}
+ */
+Maker.ISTANBUL_COMMENT = '/* istanbul ignore next */';
+
 Maker.prototype = {
 
     /**
@@ -591,6 +599,7 @@ Maker.prototype = {
         if(!this.clean.length) return '';
 
         this.clean.unshift(
+            (this.options.istanbul !== false ? Maker.ISTANBUL_COMMENT : '') +
             '(function(undefined) {',
             'var exports = undefined, modules = undefined, define = undefined;'
         );
@@ -641,7 +650,7 @@ Maker.prototype = {
         var closure = [
                 module.name,
                 ' = ',
-                module.istanbul === false ? '/* istanbul ignore next */' : '',
+                module.istanbul === false ? Maker.ISTANBUL_COMMENT : '',
                 '(',
                 module.body,
                 ').call(global'
@@ -883,15 +892,16 @@ Maker.prototype = {
      * @returns {Object}
      */
     markIstanbul: function(modules) {
-        var moduleToCoverage = this.options.istanbul;
-        if(!moduleToCoverage) return modules;
+        var modulesToCoverage = this.options.istanbul;
+        if(!modulesToCoverage) return modules;
+
+        if(typeof modulesToCoverage === 'string') {
+            modulesToCoverage = [modulesToCoverage];
+        }
 
         for(var i = 0; i < modules.length; i++) {
-            if(modules[i].name !== moduleToCoverage) {
+            if(!~modulesToCoverage.indexOf(modules[i].name)) {
                 modules[i].istanbul = false;
-            } else {
-                modules[i].istanbul = true;
-                break;
             }
         }
 
diff --git a/package.json b/package.json
index d861a04..b4111b2 100644
--- a/package.json
+++ b/package.json
@@ -1,7 +1,7 @@
 {
     "name": "definer",
     "description": "Easiest module system",
-    "version": "0.2.4",
+    "version": "0.2.5",
     "repository": {
         "type": "git",
         "url": "https://github.com/tenorok/definer.git"
@@ -24,7 +24,7 @@
     "devDependencies": {
         "mocha": "~1.15.1",
         "chai": "~1.8.1",
-        "jsdoc": "~3.3.0"
+        "jsdoc": "3.3.0-alpha8"
     },
     "main": "main.js",
     "bin": {
diff --git a/test/maker/helper.js b/test/maker/helper.js
index 1093acf..2d0d41a 100644
--- a/test/maker/helper.js
+++ b/test/maker/helper.js
@@ -281,7 +281,7 @@ var closure = {
             '    ){\n' +
             '        return a + b + \'c\';\n' +
             '    }).call(global, a, b, c),\n' +
-            'e = (function (d) { return d + \'e\'; }).call(global, d),\n' +
+            'e = /* istanbul ignore next */(function (d) { return d + \'e\'; }).call(global, d),\n' +
             'f = (function () { return \'f\'; }).call(global);\n' +
             '})(this);';
     },
@@ -290,7 +290,7 @@ var closure = {
         return '(function(global, undefined) {\n' +
             'var a = /* istanbul ignore next */(function () { return \'a\'; }).call(global),\n' +
             'b = (function (a){return a + \'b\';}).call(global, a),\n' +
-            'c = (function (a, b) {\n' +
+            'c = /* istanbul ignore next */(function (a, b) {\n' +
             '    return a + b + \'c\';\n' +
             '}).call(global, a, b);\n' +
             '})(this);';
@@ -304,7 +304,21 @@ var closure = {
             'var z = /* istanbul ignore next */definer.export("z", (function () { return { nameZ: \'valueZ\' }; }).call(global)),\n' +
             'y = (function (z) { return \'z\'; }).call(global, z);\n' +
             '})(this);';
-    }
+    },
+
+    getClosureStringMakeCleanFilesModuleCIstanbul: function() {
+        return '/* istanbul ignore next */(function(undefined) {\n' +
+            'var exports = undefined, modules = undefined, define = undefined;\n' +
+            '(function(global) { global.$ = \'jquery\'; })(this);\n' +
+            '(function(global) { (global.$ || {}).ui = \'jquery.ui\'; })(this);\n' +
+            '(function(global) { (global.$ || {}).plugin = \'jquery.plugin\'; })(this);\n' +
+            '}).call(this);\n' +
+            '(function(global, undefined) {\n' +
+            'var $ = global.$,\n' +
+            'c = (function ($) { return \'c\'; }).call(global, $);\n' +
+            '["$"].forEach(function(g) { delete global[g]; });\n' +
+            '})(this);';
+    },
 
 };
 
diff --git a/test/maker/make-istanbul.js b/test/maker/make-istanbul.js
index 91ab1e9..ec9901a 100644
--- a/test/maker/make-istanbul.js
+++ b/test/maker/make-istanbul.js
@@ -12,11 +12,11 @@ describe('Сборка модулей для тестирования покры
         var savePromise = vow.promise(),
             saveFilePath = path.join(__dirname, 'modules/all.js');
 
-        it('Все обычные модули', function(done) {
+        it('Все обычные модули и несколько целевых модулей для istanbul', function(done) {
 
             new Maker({
                 directory: path.join(__dirname, 'modules'),
-                istanbul: 'd',
+                istanbul: ['d', 'f'],
                 verbose: ['error']
             }).make(saveFilePath).then(function() {
 
@@ -29,7 +29,7 @@ describe('Сборка модулей для тестирования покры
                 }).done();
         });
 
-        it('Заданный модуль', function(done) {
+        it('Заданный модуль для сборки с одним целевым модулем для istanbul', function(done) {
 
             new Maker({
                 directory: path.join(__dirname, 'modules'),
@@ -47,7 +47,7 @@ describe('Сборка модулей для тестирования покры
                 }).done();
         });
 
-        it('Заданные модуль с присутствием экспортируемых модулей', function(done) {
+        it('Заданный модуль с присутствием экспортируемых модулей', function(done) {
 
             new Maker({
                 directory: path.join(__dirname, 'modules2'),
@@ -75,10 +75,15 @@ describe('Сборка модулей для тестирования покры
 
     describe('CLI.', function() {
 
-        var cli = new helper.testCLI('./bin/definer -v e -d test/maker/modules/').setTarget('test/maker/modules/all.js');
+        var cli = new helper.testCLI('./bin/definer -v e').setTarget('test/maker/modules/all.js');
 
-        it('Все обычные модули', function(done) {
-            cli.exec('-i d', helper.getClosureStringIstanbul(), done);
+        it('Все обычные модули и несколько целевых модулей для istanbul', function(done) {
+            cli.exec('-d test/maker/modules/ -i d,f', helper.getClosureStringIstanbul(), done);
+        });
+
+        it('Clean-скрипты так же должны предваряться istanbul-комментарием', function(done) {
+            cli.exec('-d test/maker/clean/ -c test/maker/clean/clean.json -i c -m c',
+                helper.getClosureStringMakeCleanFilesModuleCIstanbul(), done);
         });
 
         after(function(done) {