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# Einfaktorielle Varianzanalyse {#einfaktorielle-varianzanalyse}
\normalsize
## Anwendungsszenario {#sec-anwendungsszenario}
Das Anwendungsszenario einer einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse ist
durch das Vorliegen von multivariaten Datenpunkten von zwei oder mehr Gruppen
randomisierter experimenteller Einheiten gekennzeichnet, die sich hinsichtlich
der Level eines experimentellen Faktors unterscheiden. Ist die Anzahl an
Datenpunkten in jeder Gruppe gleich, so spricht von einem balancierten einfaktoriellen
multivariaten Varianzanalysedesign. Von den Datenpunkten der *i*ten Gruppe bzw.
des *i*ten Faktorlevels wird angenommen, dass sie Realisierungen von jeweils
$n_i$ unabhängigen und identisch multivariat normalverteilten Zufallsvektoren sind,
deren wahre, aber unbekannte, Erwartungswertparameter sich potentiell über die
Gruppen hinweg unterscheiden und deren wahrer, aber unbekannter, Kovarianzmatrixparameter
über die Gruppen hinweg identisch ist. In diesen Grundannahmen handelt es beim
Anwendungsszenario der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse also um die
Generalisierung des Einstichproben-T$^2$-Test Szenarios zu zwei oder mehr Gruppen
experimenteller Einheiten. Grundlegend wird voraussgesetzt, dass ein Interesse
am einem inferentiellen Vergleich, der wahren, aber unbekannten,
faktorlevelspezifischen Erwartungswertparameter besteht.
### Anwendungsbeispiel {-}
Als konkretes Anwendungsbeispiel betrachten wir die Anlayse von Prä-Post-Interventions-BDI-Score und
Prä-Post-Interventions-Glukokortikoidplasmalevel Differenzenwerten von drei
Gruppen von jeweils 15 Patienti:innen, die unterschiedliche Psychotherapiesettings
(Face-to-face und Online) bzw. eine Wartelistenkontrollbedingung durchlaufen haben.
Wir stellen dazu in @tbl-bdi-glu einen simulierten Beispieldatensatz dar. Die erste
Spalte von @tbl-bdi-glu (`COND`) listet das spezifische Therapiesetting
(`F2F`: Face-to-face, `ONL`: online, `WLC`: waitlist control) der Patient:innen
auf. Die zweite Spalte (`dBDI`) listet die entsprechenden BDI-Score-Differenzwerte
und die dritte Spalte (`dGLU`) die entsprechenden Glukokortikoidplasmalevel-Differenzwerte auf.
In beiden Fällen zeigen positive Werte eine Abnahme der Depressionssymptomatik, negative
Werte dagegen einer Zunahme der Depressionssymptomatik an. @fig-anwendungsbeispiel
visualisiert diesen Datensatz sowie die gruppenspezifischen Stichprobenmittel und
Stichprobenkovarianzen als Normalverteilungsisokonturen.
```{r, echo = F, warning = F}
library(MASS) # Multivariate Normalverteilung
set.seed(1) # Ergebnisreproduzierbarkeit
n_i = c(15,15,15) # Anzahl Patient:innen pro Gruppe
p = length(n_i) # Anzahl Gruppen
n = sum(n_i) # Gesamtzahl Datenpunkte
mu_1 = c(10,4) # Erwartungswertparameter F2F
mu_2 = c(8,3) # Erwartungswertparameter ONL
mu_3 = c(2,1) # Erwartungswertparameter WLC
Sigma_1 = matrix(c(3,.5,.5,1), nrow = 2) # Kovarianzmatrixparameter F2F
Sigma_2 = matrix(c(3,.5,.5,1), nrow = 2) # Kovarianzmatrixparameter ONL
Sigma_3 = matrix(c(3, 0, 0,1), nrow = 2) # Kovarianzmatrixparameter WLC
y_1 = mvrnorm(n_i[1], mu_1, Sigma_1) # Daten F2F
y_2 = mvrnorm(n_i[2], mu_2, Sigma_2) # Daten ONL
y_3 = mvrnorm(n_i[3], mu_3, Sigma_3) # Daten WLC
D = data.frame(
COND = c(rep("F2F",n_i[1]), rep("ONL", n_i[2]),rep("WLC", n_i[3])),
dBDI = c(round(y_1[,1]), round(y_2[,1]), round(y_3[,1])),
dGLU = c( y_1[,2], y_2[,2], y_3[,2]))
fname = "./_data/503-einfaktorielle-varianzanalyse.csv" # Dateiname
write.csv(D, file = fname, row.names = FALSE) # Speichern
```
\newpage
\footnotesize
\renewcommand{\arraystretch}{1.2}
```{r echo = F, warning = F}
#| label: tbl-bdi-glu
#| tbl-cap : "Prä-Post-Interventions-BDI-II-Score und -Glukokortikoidplasmalevel Differenzenwerte von drei Studiengruppen (F2F: Face-to-face, ONL: online, WLC: waitlist control) jeweils 15 Patient:innen"
library(knitr) # knitr für Tabellen
D = read.csv("./_data/503-einfaktorielle-varianzanalyse.csv") # Dateneinlesen
kable(D, digits = 1, align = "c") # Datentabelle
```
\newpage
\normalsize
Folgender **R** Code demonstriert die Auswertung gruppenspezifischer
Deskriptivstatistiken für diesen Datensatz.
\tiny
```{r, warning = F}
# Studiengruppenspezifische Deskriptivstatistiken
D = read.csv("./_data/503-einfaktorielle-varianzanalyse.csv") # Dateneinlesen
m = 2 # Datendimension von Interesse
p = 3 # Anzahl Gruppen
k = 15 # Anzahl Datenpunkte pro Gruppe
Y = array(dim = c(m,k,p)) # Datenarrayinitialisierung
Y[,,1] = rbind(D$dBDI[D$COND == "F2F"], # F2F dBDI Werte
D$dGLU[D$COND == "F2F"]) # F2F dGLU Werte
Y[,,2] = rbind(D$dBDI[D$COND == "ONL"], # ONL dBDI Werte
D$dGLU[D$COND == "ONL"]) # ONL dGLU Werte
Y[,,3] = rbind(D$dBDI[D$COND == "WLC"], # WLC dBDI Werte
D$dGLU[D$COND == "WLC"]) # WLC dGLU Werte
y_bar_i = array(dim = c(m,p)) # Stichprobenmittelarray
C_i = array(dim = c(m,m,p)) # Stichprobenkovarianzmatrizenarray
j_k = matrix(rep(1,k), nrow = k) # 1_{l}
I_k = diag(k) # Einheitsmatrix I_l
J_k = matrix(rep(1,k^2), nrow = k) # 1_{ll}
for (i in 1:p){ # Gruppeniterationen
y_bar_i[,i] = (1/k)*(Y[,,i] %*% j_k) # Stichprobenmittel \bar{\upsilon}_i
C_i[,,i] = (1/(k-1))*(Y[,,i] %*% (I_k-(1/k)*J_k) %*% t(Y[,,i]))} # Stichprobenkovarianzmatrix C_i
```
\normalsize
```{r, echo = F, eval = F}
library(ellipse)
library(latex2exp)
pdf(
file = "_figures/503-anwendungsbeispiel.pdf",
width = 6,
height = 6)
par(
family = "sans",
mfcol = c(1,1),
pty = "s",
bty = "l",
lwd = 1,
las = 1,
mgp = c(2,1,0),
xaxs = "i",
yaxs = "i",
font.main = 1,
cex = 1,
cex.main = 1)
cols = c("Gray20", "Gray50", "Gray80")
plot(
NaN,
NaN,
xlim = c(-5,15),
ylim = c(-1,6),
xlab = TeX("dBDI"),
ylab = TeX("dGLU"))
for (i in 1:p){
points(
Y[1,,i],
Y[2,,i],
col = "White",
bg = cols[i],
pch = 21)
points(
y_bar_i[1,i],
y_bar_i[2,i],
col = cols[i],
pch = 1)
iso = ellipse(C_i[,,i], level = .6, centre = y_bar_i[,i])
lines(
iso[,1],
iso[,2],
col = cols[i])
}
legend(
"topleft",
c("F2F", "ONL", "WLC"),
pch = c(21,21,21),
bg = cols,
col = cols,
bty = "n",
cex = 1,
x.intersp = 1)
dev.off()
```
![Deskriptivstatistiken der `dBDI`, `dGLU` Daten des Beispieldatensatzes. Jeder
Punkt visualisiert die Daten einer Patient:in. Die Stichprobenkovarianz ist durch
die 0.7 Isokontur einer zweidimensionalen Normalverteilung mit Erwartungswertparameter
und Kovarianzmatrixparameter entsprechend dem Stichprobenmittel und der Stichprobenkovarianz
der jeweiligen Gruppe dargestellt.](./_figures/503-anwendungsbeispiel){#fig-anwendungsbeispiel fig-align="center" width=50%}
## Modellformulierung und Modellschätzung {#sec-modellformulierung-und-modellschätzung}
Wir definieren das Modell einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse wie folgt.
:::{#def-modell-der-einfaktoriellen-varianzanalyse}
## Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse
Für $i = 1,...,p$ und $j = 1,...,n_i$ seien $\upsilon_{ij}$ $m$-dimensionale
Zufallsvektoren, die die $n := \sum_{i=1}^p n_i$ $m$-dimensionalen Datenpunkte
eines einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyseszenarios modellieren. Dann hat
das Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse die strukturelle Form
\begin{equation}
\upsilon_{ij} = \mu_i + \varepsilon_{ij}
\mbox{ mit } \varepsilon_{ij} \sim N(0_m,\Sigma) \mbox{ u.i.v. }
\mbox{ mit } \mu_i \in \mathbb{R}^m \mbox{ und } \Sigma \in \mathbb{R}^{m \times m} \mbox{ pd }
\end{equation}
und die Datenverteilungsform
\begin{equation}
\upsilon_{ij} \sim N(\mu_i,\Sigma) \mbox{ u.v. mit } \mu_i \in \mathbb{R}^m \mbox{ und } \Sigma \in \mathbb{R}^{m \times m} \mbox{ pd}.
\end{equation}
:::
In @def-modell-der-einfaktoriellen-varianzanalyse bezeichnet $n_i$ die Anzahl
der Zufallsvektoren $\upsilon_{ij}$ der $i$ten von $p$ Gruppen experimenteller Einheiten.
Im Falle eines balancierten Designs gilt offenbar $n_1 = \cdots = n_p$. In diesem Fall
setzen wir der Einfachheit halber $k := n_i$ für $i = 1,...,p$. In diesem Fall gilt
für die Gesamtanzahl an Zufallsvektoren dann $n = pk$. Die Äquivalenz von struktureller Form und Datenverteilungsform
der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse ergibt sich mit @thm-linear-affine-transformation
durch Transformation der $\varepsilon_{ij}$ unter Multiplikation mit der Einheitsmatrix
und unter Addition der jeweiligen gruppenspezifischen Erwartungswertparameter.
Die wahren, aber unbekannten, Parameter $\mu_i, i = 1,...,p$ und $\Sigma$ des
einfaktoriellen multivariaten Varianzanalysemodells können anhand der in folgendem
Theorem definierten Schätzer geschätzt werden.
:::{#thm-parameterschätzer}
## Parameterschätzer der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse
Gegeben sei das Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse. Dann
ist für $i = 1,...,p$
\begin{equation}
\hat{\mu}_i := \frac{1}{n_i}\sum_{j = 1}^{n_i} \upsilon_{ij}
\end{equation}
ein unverzerrte Schätzer des gruppenspezifischen Erwartungswertparameters $\mu_i$ und
\begin{equation}
\hat{\Sigma} := \frac{1}{n-p}\sum_{i = 1}^p \sum_{j = 1}^{n_i} \left(\upsilon_{ij} - \hat{\mu}_i\right)\left(\upsilon_{ij} - \hat{\mu}_i\right)^T
\end{equation}
ein unverzerrter Schätzer des Kovarianzmatrixparameters $\Sigma$.
:::
In @thm-parameterschätzer ist $\hat{\mu}_i$ offenbar das Stichprobenmittel der
Zufallsvektoren der $i$ten Gruppe. $\hat{\Sigma}$ ist die gruppenunspezifische
Stichprobenkovarianzmatrix aller Zufallsvektoren und entspricht der mit
$1/(n-p)$ skalierten *Within-Group Sum-of-Squares Matrix*, die wir in
@thm-kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung einführen werden. Folgender **R**
demonstriert die Evaluation der Parameterschätzer mithilfe einer **R** Funktion.
\tiny
```{r}
estimate = function(Y){
# Diese Funktion evaluiert die Parameterschätzer einer einfaktoriellen
# multivariaten Varianzanalyse basierend auf einen m x k x p Datensatz Y.
#
# Input
# Y : m x k x p Datenarray
#
# Output
# $mu_hat : m x p \mu_i Parameterschätzer
# $Sigma_hat : m x m \Sigma Parametschätzer
# ---------------------------------------------------------------------------
# Dimensionsparameter
d = dim(Y) # Datensatzdimensionen
m = d[1] # Datendimension
k = d[2] # Anzahl Datenpunkte pro Gruppe
p = d[3] # Anzahl Gruppen
# Erwartungswertparameterschätzer
mu_hat_i = matrix(apply(Y,3,rowMeans), nrow = m)
# Kovarianzmatrixparameterschätzer
Sigma_hat = matrix(rep(0,m*m), nrow = m)
for(i in 1:p){
for(j in 1:k){
Sigma_hat = Sigma_hat + (1/(k*p-p))*(Y[,j,i] - mu_hat_i[,i]) %*% t(Y[,j,i] - mu_hat_i[,i])
}
}
# Outputspezifikation
return(list(mu_hat_i = mu_hat_i, Sigma_hat = Sigma_hat))}
```
\normalsize
Anstelle eines Beweises validieren wir die Aussage von @thm-parameterschätzer
beispielhaft mithilfe folgender **R** Simulation, in der wir die Erwartungswerte
der Schätzer durch ihre Stichprobenmittelwerte über Datensatzrealisierungen hinweg
approximieren.
\tiny
```{r, eval = F}
# Modellparameter
library(MASS) # multivariate Normalverteilungen
p = 3 # Anzahl Gruppen
k = 15 # Anzahl Datenpunkte pro Gruppe
m = 2 # Datendimension
mu_i = matrix(c(1,2,2,1,3,2.5), ncol = p) # Erwartungswertparameter
Sigma = matrix(c(1,.5,.5,1) , ncol = m) # Kovarianzmatrixparameter
# Simulationsparameter und Arrays
nsm = 1e2 # Anzahl Simulation
mu_hat_is = array(dim = c(m,p,nsm)) # \hat{\mu}_i Array
Sigma_hats = array(dim = c(m,m,nsm)) # \hat{\Sigma} Array
# Simulationen
for(s in 1:nsm){
# Datengeneration
Y = array(dim = c(m,k,p)) # Datenarray
for(i in 1:p){
Y[,,i] = t(mvrnorm(k,mu_i[,i],Sigma)) # Datengeneration
}
S = estimate(Y) # Parameterschätzung
mu_hat_is[,,s] = S$mu_hat_i # \hat{\mu}_i
Sigma_hats[,,s] = S$Sigma_hat # \hat{\Sigma}
}
# Schätzererwartungswertschätzung
E_hat_mu_i_hat = apply(mu_hat_is , c(1,2), mean)
E_hat_Sigma_hat = apply(Sigma_hats, c(1,2), mean)
```
\normalsize
Wie in @fig-parameterschätzer ergibt sich hier auch schon bei
einem recht geringen Simulationsaufwand von 100 Datensatzrealisierungen eine
gute Korrespondenz zwischen wahren, aber unbekannten, Parameterwerten $\mu_i, i = 1,...,p$
und $\Sigma$ und den approximierten Erwartungswertparametern
$\mathbb{E}(\hat{\mu}_i)$ für $i = 1,...,p$ und $\mathbb{E}(\hat{\Sigma})$.
```{r, echo = F, eval = F}
library(ellipse)
library(latex2exp)
pdf(
file = "_figures/503-parameterschätzer.pdf",
width = 6,
height = 6)
par(
family = "sans",
mfcol = c(1,1),
pty = "s",
bty = "l",
lwd = 1,
las = 1,
mgp = c(2,1,0),
xaxs = "i",
yaxs = "i",
font.main = 1,
cex = 1.2,
cex.main = 1.2)
cols = c("Black", "Gray70")
plot(
NaN,
NaN,
xlim = c(0,4),
ylim = c(0,4),
xlab = TeX("$\\upsilon_{ij_1}$"),
ylab = TeX("$\\upsilon_{ij_2}$"),
main = "")
for (i in 1:p){
points(
mu_i[1,i],
mu_i[2,i],
col = cols[1],
pch = 19)
points(
E_hat_mu_i_hat[1,i],
E_hat_mu_i_hat[2,i],
col = cols[2],
pch = 1)
iso_1 = ellipse(Sigma, level = 0.2, centre = mu_i[,i])
lines(
iso_1[,1],
iso_1[,2],
col = cols[1])
iso_2 = ellipse(E_hat_Sigma_hat, level = 0.2, centre = E_hat_mu_i_hat[,i])
lines(
iso_2[,1],
iso_2[,2],
col = cols[2])
}
legend(
"topleft",
c("Wahre, aber unbekannte, Parameter", "Geschätzte Parameterschätzererwartungswerte"),
lty = 1,
bg = cols,
col = cols,
bty = "n",
cex = .7,
x.intersp = 1)
dev.off()
```
![Simulationsbasierte Validierung des Theorems zu den Parameterschätzern der
einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse am Beispiel von $m := 2,p := 3, k := 15$
und 100 Realisierungen der entsprechenden multivariat normalverteilten Zufallsvektoren](./_figures/503-parameterschätzer){#fig-parameterschätzer fig-align="center" width=50%}
Die Anwendung der Parameterschätzung auf die Daten des Beispieldatensatzes in
@tbl-bdi-glu ergibt folgende Resultate.
\tiny
```{r}
S = estimate(Y) # Parameterschätzung
```
```{r echo = F}
print(S$mu_hat_i) # Ausgabe
print(S$Sigma_hat) # Ausgabe
```
\normalsize
## Modellevaluation {#sec-modellevaluation}
Primäres Ziel einer einfaktoriellen multifaktoriellen Varianzanalyse ist meist
das Testen der Nullhypothese
\begin{equation}
H_0 : \mu_1 = \cdots = \mu_p.
\end{equation}
Diese Nullhypothese besagt, dass keine Unterschiede zwischen den wahren, aber
unbekannten, Erwartungswertparametern der Stichprobengruppen bestehen. Die
Alternativhypothese lautet somit
\begin{align}
\begin{split}
H_1 : \mu_{i_l} \neq \mu_{j_l}
&
\mbox{ für mindestens ein Paar } i,j
\mbox{ mit } i \neq j, 1 \le i,j \le p
\\
&
\mbox{ und mindestens ein } l
\mbox{ mit } 1 \le l \le m.
\end{split}
\end{align}
Die Alternativhypothese besagt also, dass sich mindestens zwei wahre, aber unbekannten,
Erwartungswertparameter in mindestens einer ihrer Komponenten unterscheiden. Wie
aus dem Kontext der univariaten einfaktorielle Varianzanalyse bekannt impliziert
das Ablehnen der Nullhypothese auch hier keine Aussage über die genaue Form
des inferierten Erwartungswertparameterunterschiedes.
Im Rahmen einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse können Tests der
Nullhypothese mit verschiedenen Teststatistiken konstruiert werden. Diesen
Teststatistiken ist gemein, dass sie auf eine Generalisierung der aus dem
univariaten Fall bekannten Quadratsummenzerlegung der einfaktoriellen Varianzanalyse
zurückgehen. Wir führen im nächsten Abschnitt zunächst diese sogenannte
*Kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung* der einfaktoriellen multivariaten
Varianzanalyse ein. Nachfolgend betrachten wir dann die Modellevaluation mithilfe
der *Wilks'-$\Lambda$-Statistik*.
### Kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung {-}
Folgendes Theorem generalisiert die Quadratsummenzerlegung der einfaktoriellen
Varianzanalyse auf das multivariate Anwendungsszenario.
:::{#thm-kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung}
## Kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung
Gegeben sei das Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse. Weiterhin seien
\begin{equation}
\bar{\upsilon} := \frac{1}{n}\sum_{i = 1}^p \sum_{j = 1}^{n_i} \upsilon_{ij}
\mbox{ und }
\bar{\upsilon}_i := \frac{1}{n_i} \sum_{j = 1}^{n_i} \upsilon_{ij}
\end{equation}
das \textit{Gesamtstichprobenmittel} und das \textit{$i$te Gruppenstichprobenmittel}, respektive.
Schließlich seien
\begin{tabular}{ll}
$T := \sum_{i = 1}^p \sum_{j = 1}^{n_i} \left(\upsilon_{ij} - \bar{\upsilon}\right)\left(\upsilon_{ij} - \bar{\upsilon}\right)^T$
&
die \textit{Totale Sum-of-Squares Matrix}
\\
\\
$B := \sum_{i = 1}^p n_i \left(\bar{\upsilon}_{i} - \bar{\upsilon}\right)\left(\bar{\upsilon}_{i} - \bar{\upsilon}\right)^T$
&
die \textit{Between-Group Sum-of-Squares Matrix}
\\
\\
$W := \sum_{i = 1}^p \sum_{j = 1}^{n_i} \left(\upsilon_{ij} - \bar{\upsilon}_i\right)\left(\upsilon_{ij} - \bar{\upsilon}_i\right)^T$
&
die \textit{Within-Group Sum-of-Squares Matrix}.
\end{tabular}
Dann gilt
\begin{equation}
T = B + W.
\end{equation}
:::
:::{.proof}
Es gilt
\begin{align}
\begin{split}
T
& = \sum_{i=1}^p \sum_{j=1}^{n_i}(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon})(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon})^T
\\
& = \sum_{i=1}^p \sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i+\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i+\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\\
& = \sum_{i=1}^p \sum_{j=1}^{n_i} \left((\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)+(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})\right)\left((\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)+(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})\right)^T
\\
& = \sum_{i=1}^p \sum_{j=1}^{n_i} \left(
(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+2(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+ (\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p \left(
\sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+\sum_{j=1}^{n_i}2(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+\sum_{j=1}^{n_i}(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p \left(
\sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+2\left(\sum_{j=1}^{n_i}(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)\right)(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+n_i(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p \left(
\sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+2\left(\sum_{j=1}^{n_i}\left(\upsilon_{ij}-\frac{1}{n_i}\sum_{j=1}^{n_i} \upsilon_{ij}\right)\right)(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+n_i(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p \left(
\sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+2\left(\sum_{j=1}^{n_i} \upsilon_{ij}-\sum_{j=1}^{n_i} \upsilon_{ij}\right) (\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+n_i(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p \left(
\sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
+n_i(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
\right)
\\
& = \sum_{i=1}^p n_i(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})(\bar{\upsilon}_i-\bar{\upsilon})^T
+\sum_{i=1}^p \sum_{j=1}^{n_i} (\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)(\upsilon_{ij}-\bar{\upsilon}_i)^T
\\
& = B + W.
\end{split}
\end{align}
:::
Die intuitive Interpretation der Totalen, Between-Group, und Within-Group Sum-of-Squares
Matrizen ist analog zu den aus dem univariaten Szenario bekannten Begriffen: Die
Matrix $T$ repräsentiert die totale Variabilität der Datenvektoren um das
Gesamtstichprobenmittel, die Matrix $B$ repräsentiert die Variabilität der
Gruppenstichprobenmittel um das Gesamtstichprobenmittel und die Matrix $W$
repräsentiert die Variabilität der Datenvektoren um ihre jeweiligen
Gruppenstichprobenmittel. Wie im univariaten Fall wird auch hier also die
Gesamtdatenvariabilität additiv in zwei unabhängige Beiträge zerlegt. Dabei kann
die Matrix $W$ auch als Maß für die Residualvariabiliät verstanden werden, weil
sie die verbleibende Variabilität nach Schätzung der Gruppenerwartungswertparameter
quantifiziert. Offenbar gilt für den Schätzer $\hat{\Sigma}$ des gemeinsamen Stichprobenkovarianzmatrixparameters aus @thm-parameterschätzer
\begin{equation}
W = (n - p)\hat{\Sigma}.
\end{equation}
Folgender **R** demonstriert die Evaluation der in @thm-kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung
definierten Matrizen mithilfe einer **R** Funktion.
\tiny
```{r}
sos = function(Y){
# Diese Funktion evaluiert die Kreuzproduktsummenmatrizen T,B,W einer
# einfaktoriellen Varianzanalyse basierend auf einen m x k x p Datensatz Y.
#
# Input
# Y : m x k x p Datenarray
#
# Output
# $y_bar : m x 1 Gesamtmittelwert
# $y_bar_i : m x p Gruppenmittelwerte
# $T : m x m Total Sum of Squares Matrix
# $B : m x m Between-Group Sum-of-Squares Matrix
# $W : m x m Within Group Sum of Squares Matrix
# ---------------------------------------------------------------------------
d = dim(Y) # Datensatzdimensionen
m = d[1] # Datendimension
k = d[2] # Anzahl Datenpunkte pro Gruppe
p = d[3] # Anzahl Gruppen
# Mittelwerte
y_bar_i = matrix(apply(Y,3,rowMeans), nrow = m) # Gruppenstichprobenmittel
y_bar = matrix(rowMeans(y_bar_i) , nrow = m) # Gesamtstichprobenmittel
# Totale Sum-of-Squares Matrix
T = matrix(rep(0,m*m), nrow = m)
for(i in 1:p){
for(j in 1:k){
T = T + (Y[,j,i] - y_bar) %*% t(Y[,j,i] - y_bar)}}
# Between Sum of Squares Matrix
B = matrix(rep(0,m*m), nrow = m)
for(i in 1:p){
B = B + k*(y_bar_i[,i] - y_bar) %*% t(y_bar_i[,i] - y_bar)}
# Within Sum of Squares Matrix
W = matrix(rep(0,m*m), nrow = m)
for(i in 1:p){
for(j in 1:k){
W = W + (Y[,j,i] - y_bar_i[,i]) %*% t(Y[,j,i] - y_bar_i[,i])}}
# Outputspezifikation
return(list(y_bar_i = y_bar_i, y_bar = y_bar, T = T, B = B, W = W))}
```
\normalsize
### Modellevaluation mit der Wilks'-$\Lambda$-Statistik {-}
Basierend auf der Kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung in @thm-kreuzproduktsummenmatrizenzerlegung
wurde eine Reihe von Teststatisken für die einfaktorielle multivariate Varianzanalyse
vorgeschlagen (@wilks1932, @pillai1955, @roy1953, @hotelling1951). Wir betrachten
hier exemplarisch lediglich die *Wilks'-$\Lambda$-Statistik* nach @wilks1932.
Im Gegensatz zur $F$-Teststatistik der univariaten einfaktoriellen Varianzanalyse
sind die Frequentistischen Verteilungen von der Wilks'-$\Lambda$-Statistik bei
Zutreffen der Nullhypothese nur für bestimmte Anwendungsszenarien, insbesondere
bei kleinen Werte der Datendimension $m$ und der Gruppenanzahl $p$, analytisch
exakt zu bestimmen. In diesen Szenarien ist man auf $f$-Verteilungen mit $m$- und $p$-abhängigen
Freiheitsgradparametern geführt. Für Anwendungsszenarien mit größeren Werten von
$m$ und/oder $p$ existieren lediglich Approximationen der Frequentistischen Verteilungen der
Wilks'-$\Lambda$-Statistik, die nur asymptotisch für unendlich große Stichprobenumfänge
$n \to \infty$ exakt sind. Auch diese Approximationen sind wiederum durch $f$-Verteilungen
mit $m$- und $p$-abhängigen Freiheitsgradparametern gegeben. In der Anwendung
unterscheiden sich Testentscheidungen basierend auf exakten oder approximativen
Verteilungen der verschiedenen Teststatistiken meist nicht. Zur Absicherung
dieser Aussage mögen im konkreten Fall von Datendimension und Gruppengröße
Simulationen helfen, mögliche Unterschiede zwischen der Wilks'-$\Lambda$-Statistik
und anderen Teststatistiken sowie der Approximation ihrer Verteilungen abzuschätzen.
Wir definieren zunächst die Wilks'-$\Lambda$-Statistik.
:::{#def-wilks-lambda-statistik}
## Wilks'-$\Lambda$-Statistik
Gegeben sei das Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse sowie die Between-Group
Sum-of-Squares Matrix $B$ und die Within-Group Sum-of-Squares Matrix $W$. Dann ist
*Wilks'-$\Lambda$-Statistik* definiert als
\begin{equation}
\Lambda := \frac{|W|}{|T|} = \frac{|W|}{|B+W|}.
\end{equation}
:::
Intuitiv misst $\Lambda$ das Verhältnis von Residualdatenvariabilität, repräsentiert
durch die Determinante von $W$, und Gesamtdatenvariabilität, repräsentiert durch die
Determinante von $T = B+W$. $\Lambda$ ist damit also analog zum Effektstärkenmaß
$\eta^2$ der univariaten einfaktoriellen Varianzanalyse definiert. Im Falle der
Gleichheit der gruppenspezifischen Stichprobenmittel gilt für $\Lambda$ insbesondere
\begin{equation}
\bar{\upsilon}_1 = \cdots = \bar{\upsilon}_p = \bar{\upsilon}
\Rightarrow
B = 0_{mm}
\Rightarrow
\Lambda = \frac{|W|}{|T|} = \frac{|W|}{|B+W|} = \frac{|W|}{|0_{mm} + W|} = \frac{|W|}{|W|} = 1.
\end{equation}
Für ansteigende Unterschiede zwischen den gruppenspezifischen Stichprobenmittel
$\bar{\upsilon}_i$ nimmt $|B+W|$ gegenüber $|W|$ zu und $\Lambda$ somit ab. Ohne Beweis
wollen wir dabei festhalten, dass $0 \le \Lambda \le 1$. Im Gegensatz zu den
meisten bekannten Teststatistiken sprechen hier also *kleine Werte der Teststatistik
$\Lambda$ für eine Abweichung von der Nullhypothese*.
Äquivalent kann $\Lambda$ auch in Form der Eigenwerte der Matrix $W^{-1}B$
angegeben werden. Dabei ist die Matrix $W^{-1}B$ das multivariate Analogon
zum dem aus der univariaten einfaktoriellen Varianzanalyse bekanntem Verhältnis
von Between-Group Sum-of-Squares und Within-Group Sum-of-Squares, welches die
Grundlage für $F$-Teststatitik im univariaten Fall bildet. Es gilt folgendes Theorem.
:::{#thm-eigenwertform-von-wilks-lambda}
## Eigenwertform von der Wilks'-$\Lambda$-Statistik
Es seien das Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse, die Between-Group
Sum-of-Squares Matrix $B$, die Within-Group Sum-of-Squares Matrix $W$ und die
Wilks'-$\Lambda$-Statistik definiert wie oben. Weiterhin seien $\lambda_1,...,\lambda_s$
die Eigenwerte von $W^{-1}B$.
Dann gilt
\begin{equation}
\Lambda = \prod_{i=1}^s \frac{1}{1 + \lambda_i}.
\end{equation}
:::
Wir verzichten auf einen Beweis.
Für spezielle, durch die Datendimension $m$ und die Gruppenanzahl $p$
charakterisierte Anwendungsszenarien stellt @wilks1932 analytische Formen für
die Verteilungen von Transformationen von $\Lambda$ unter der Nullhypothese bereit.
Dabei entsprechen diese analytischen Formen den Verteilungen von $f$-Zufallsvariablen
mit bestimmten, durch die Datendimension und Gruppenanzahl des Anwendungsszenario
vorgegebenen Freiheitsgradparametern. Wir fassen die Anwendungsszenarien, die
betreffende Transformation von $\Lambda$ und die analytischen Formen ihrer
Frequentistischen Verteilungen bei Zutreffen der Nullhypothese in folgendem
Theorem zusammen.
:::{#thm-spezielle-h0-verteilungen-von-wilks-lambda-transformationen}
## Spezielle $H_0$ Verteilungen von Transformationen der Wilks'-$\Lambda$-Statistik
Es seien das Modell der einfaktoriellen Varianzanalyse und die Wilks'-$\Lambda$-Statistik
definiert wie oben und es gelte außerdem die Nullhypothese
\begin{equation}
H_0 : \mu_1 = \cdots = \mu_p.
\end{equation}
Dann sind für die in den ersten beiden Tabellenspalten aufgeführten Spezialfällen
die in der dritten Tabellenspalte aufgeführten Statistiken $f$-Zufallsvariablen
und zwar mit den in der vierten Tabellenspalte aufgeführten Freiheitsgradparametern.
\renewcommand{\arraystretch}{1.5}
\begin{tabular}{cccc}
Datendimension $m$
& Gruppenanzahl $p$
& Statistik
& $f$-Verteilungsparameter
\\\hline
Beliebig
& 2
& $\frac{1 - \Lambda}{\Lambda} \frac{n-p-m+1}{m}$
& $m, n-p-m+1$
\\
Beliebig
& 3
& $\frac{1 - \sqrt{\Lambda}}{\sqrt{\Lambda}} \frac{n-p-m+1}{m}$
& $2m, 2(n-p-m+1)$
\\
1
& Beliebig
& $\frac{1 - \Lambda}{\Lambda} \frac{n-p}{p-1}$
& $p-1,n-p$
\\
2
& Beliebig
& $\frac{1 - \sqrt{\Lambda}}{\sqrt{\Lambda}} \frac{n-p-1}{p-1}$
& $2(p-1),2(n-p-1)$
\end{tabular}
:::
In @fig-spezielle-lambda-verteilungen visualisieren wir exemplarische
simulationsbasierte Validierungen der in @thm-spezielle-h0-verteilungen-von-wilks-lambda-transformationen
angegebenen Verteilungen.
```{r, echo = F, eval = F}
# Szenarioparameter
nsm = 1e4 # Datensimulationsanzahl
M = c(3,3,1,2) # Datendimension
P = c(2,3,4,4) # Gruppenanzahl
k = 15 # Datenpunkte pro Gruppe
N = k*P # Gesamtanzahl Datenpunkte
# Szenariensimulationen
library(MASS) # R Paket für multivariate Normalverteilungen
nsc = length(M) # Szenarienanzahl
T = matrix(rep(NaN,nsm*nsc), ncol = nsc) # Teststatistik Array
for(sc in 1:nsc){ # Szenarioiterationen
# Modellparameter
m = M[sc] # Datendimension
p = P[sc] # Gruppenanzahl
n = N[sc] # Gesamtanzahl Datenpunkte
mu_i = matrix(rep(1,m), nrow = m) # Identische Gruppenerwartungswertparameter bei H_0
Sigma = diag(m) # Identische Gruppenkovarianzmatrixparameter
# Datensimulationen
for(sm in 1:nsm){
# Datengeneration
Y = array(dim = c(m,k,p)) # Datenanarrayinitialisierung
for(i in 1:p){ # Gruppeniterationen
Y[,,i] = t(mvrnorm(k,mu_i,Sigma))} # Datensimulation
# Analyse
S = sos(Y) # Stichprobenmittel und Sum of Squares Matrizen
L = det(S$W)/det(S$W + S$B) # Wilks' Lambda
# Szenarioabhängige Teststatistik ("Prüfgröße")
if (sc == 1){t = ((1-L)/L)*((n-p-m+1)/m)}
else if(sc == 2){t = ((1-sqrt(L))/sqrt(L))*((n-p-m+1)/m)}
else if(sc == 3){t = ((1-L)/L)*((n-p)/(p-1))}
else if(sc == 4){t = ((1-sqrt(L))/sqrt(L))*((n-p-1)/(p-1))}
# Statistikrealisation
T[sm,sc] = t}}
```
```{r, echo = F, eval = F}
# figure parameters
pdf(
file = "_figures/503-spezielle-lambda-verteilungen.pdf",
width = 6,
height = 6)
par(
family = "sans",
mfcol = c(2,2),
pty = "s",
bty = "l",
lwd = 1,
las = 1,
mgp = c(2,1,0),
xaxs = "i",
yaxs = "i",
font.main = 1,
cex.main = 1)
ylimits = list(c(0,.8),c(0,1),c(0,1),c(0,1))
# Szenarioiterationen
for(sc in 1:nsc){
# Statistik Histogramm und WDF
f_min = 0
f_max = 5
f_res = 1e3
f = seq(f_min,f_max,len =f_res)
m = M[sc]
p = P[sc]
n = N[sc]
if(sc == 1){
df = c(m,n-p-m+1)}
else if(sc == 2){
df = c(2*m, 2*(n-p-m+1))}
else if(sc == 3){
df = c(p-1, n-p)}
else if(sc == 4){
df = c(2*(p-1), 2*(n-p-1))}
pdf = df(f,df[1],df[2])
hist(
T[,sc],
breaks = 50,
col = "gray90",
prob = TRUE,
xlim = c(f_min, f_max),
ylim = ylimits[[sc]],
xlab = TeX("Statistik"),
ylab = "",
main = sprintf("m = %d, p = %d", M[sc], P[sc]))
lines(
f,
pdf,
lwd = 2,
col = "darkorange")
}
dev.off()
```
![Simulation spezieller Verteilungen der Wilks'-$\Lambda$-Statistik Transformationen bei Zutreffen der Nullhypothese.](./_figures/503-spezielle-lambda-verteilungen){#fig-spezielle-lambda-verteilungen fig-align="center" width=70%}
@rao1951 hat für allgemeine Anwendungsszenarien die in folgendem Theorem angegebenen
Approximationen von Verteilungen von Transformationen der Wilks'-$Lambda$-Statistik vorgeschlagen.
Man beachte, dass sich die in diesem Theorem definierte Teststatistik $\tau$ wie in @fig-tau-lambda
gezeigt zu $\Lambda$ reziprok verhält. Geringe Werte von $\Lambda$ als Evidenz
*gegen* die Nullhypothese entsprechen also hohen Werten von $\tau$.
:::{#thm-approximative-h0-verteilungen-von-wilks-lambda-transformationen}
## Approximative $H_0$ Verteilungen von Transformationen der Wilks'-$\Lambda$-Statistik
Es seien das Modell der einfaktoriellen Varianzanalyse und die Wilks'-$\Lambda$-Statistik
definiert wie oben und es gelte außerdem die Nullhypothese
\begin{equation}
H_0 : \mu_1 = \cdots = \mu_p.
\end{equation}
Dann ist die Statistik
\begin{equation}
\tau := \frac{1 - \Lambda^{1/t}}{\Lambda^{1/t}} \frac{\nu_2}{\nu_1}
\end{equation}
mit
\begin{equation}
\nu_1 := m(p-1)
\mbox{ und }
\nu_2 := wt-\frac{1}{2}(m(p-1)-2)
\end{equation}
sowie
\begin{equation}
w := n-1-\frac{1}{2}(m+p)
\mbox{ und }
t := \sqrt{\frac{m^2(p-1)^2 - 4}{m^2 + (p-1)^2 - 5}}
\end{equation}
approximativ $f$-verteilt mit Freiheitsgradparametern $\nu_1$ und $\nu_2$.
:::
```{r, echo = F, eval = F}
library(latex2exp)
pdf(
file = "_figures/503-tau-lambda.pdf",
width = 6,
height = 4)
par(
family = "sans",
mfcol = c(1,1),
pty = "m",
bty = "l",
lwd = 1,
las = 1,
mgp = c(2,1,0),
xaxs = "i",
yaxs = "i",
font.main = 1,
cex.main = 1)
cols = c("gray20","gray40","gray60","gray80")
matplot(
as.matrix(WL),
t(TL),
ylim = c(0,20),
type = "l",
lty = 1,
col = cols,
xlab = TeX("$\\Lambda$"),
ylab = TeX("$\\tau$"))
legend(
0.6,
20,
c("m = 3, p = 4, n = 15",
"m = 3, p = 9, n = 15",
"m = 4, p = 4, n = 15",
"m = 9, p = 4, n = 15"),
lty = 1,
col = cols,
pch = NA,
bty = "n",
y.intersp = 1.2,
cex = 0.9)
dev.off()
```
![Beziehung der Wilks'-$\Lambda$-Statistik und der von @rao1951 betrachteten $\tau$ Statistik in exemplarischen Anwendungsszenarien.](./_figures/503-tau-lambda){#fig-tau-lambda fig-align="center" width=70%}
In @fig-approximative-lambda-verteilungen visualisieren wir exemplarische
simulationsbasierte Validierungen der in @thm-approximative-h0-verteilungen-von-wilks-lambda-transformationen angegebenen
Verteilungen.
```{r, eval = F, echo = F}
# Szenarioparameter
library(MASS) # R Paket für multivariate Normalverteilungen
nsm = 1e4 # Datensimulationsanzahl
M = c(3,3,4,9) # Datendimension
P = c(4,9,4,4) # Gruppenanzahl
k = 15 # Datenpunkte pro Gruppe
N = k*P # Gesamtanzahl Datenpunkte
nsc = length(M) # Szenarienanzahl
TAU = matrix(rep(NaN,nsm*nsc), ncol = nsc) # Statistik Array
NU = matrix(rep(NaN,2*nsc) , ncol = nsc) # Parameter Array
WL = seq(0,1,len = 1e3) # Wilk's Lambda Values
TL = matrix(rep(NaN,length(WL)*nsc), nrow = nsc) # \tau(\Lambda) Array
for(sc in 1:nsc){ # Szenarioiterationen
# Modellparameter
m = M[sc] # Datendimension
p = P[sc] # Gruppenanzahl
n = N[sc] # Gesamtanzahl Datenpunkte
mu_i = matrix(rep(1,m), nrow = m) # Identische Gruppenerwartungswertparameter bei H_0
Sigma = diag(m) # Identische Gruppenkovarianzmatrixparameter
# Varianzanalyse Parameter
w = n-1-(1/2)*(m+p) # w
t = sqrt((m^2*(p-1)^2-4)/(m^2+(p-1)^2-5)) # t
nu_1 = m*(p-1) # \nu_1
nu_2 = w*t-(1/2)*(m*(p-1)-2) # \nu_2
TL[sc,] = ((1-WL^(1/t))/WL^(1/t))*(nu_2/nu_1) # \tau(\Lambda)
# Datensimulationen
for(sm in 1:nsm){
# Datengeneration
Y = array(dim = c(m,k,p)) # Datenanarrayinitialisierung
for(i in 1:p){ # Gruppeniterationen
Y[,,i] = t(mvrnorm(k,mu_i,Sigma))} # Datensimulation
# Varianzanalyse
S = sos(Y) # Stichprobenmittel und Sum of Squares Matrizen
L = det(S$W)/det(S$W + S$B) # Wilks' Lambda
tau = ((1-L^(1/t))/L^(1/t))*(nu_2/nu_1) # Statistik
TAU[sm,sc] = tau # Statistik
NU[1,sc] = nu_1 # \nu_1
NU[2,sc] = nu_2}} # \nu_2
```
```{r, echo = F, eval = F}
library(latex2exp)
pdf(
file = "_figures/503-approximative-lambda-verteilungen.pdf",
width = 6,
height = 6)
par(
family = "sans",
mfcol = c(2,2),
pty = "s",
bty = "l",
lwd = 1,
las = 1,
mgp = c(2,1,0),
xaxs = "i",
yaxs = "i",
font.main = 1,
cex.main = 1)
ylimits = list(c(0,1.6),c(0,1.6),c(0,1.6),c(0,1.6))
# Szenarioiterationen
for(sc in 1:nsc){
# Statistik Histogramm und WDF
f_min = 0
f_max = 3
f_res = 1e3
f = seq(f_min,f_max,len =f_res)
pdf = df(f,NU[1,sc], NU[2,sc])
hist(
TAU[,sc],
breaks = 50,
col = "gray90",
prob = TRUE,
xlim = c(f_min, f_max),
ylim = ylimits[[sc]],
xlab = TeX("Statistik"),
ylab = "",
main = sprintf("m = %d, p = %d", M[sc], P[sc]))
lines(
f,
pdf,
lwd = 2,
col = "darkorange")
}
dev.off()
```
![Simulation approximativer Verteilungen der Wilks'-$\Lambda$-Statistik Transformationen bei Zutreffen der Nullhypothese.](./_figures/503-approximative-lambda-verteilungen){#fig-approximative-lambda-verteilungen fig-align="center" width=80%}
Mithilfe der von @rao1951 bestimmten approximativen Verteilungen der transformierten
Wilks'-$\Lambda$-Statistik $\tau$ bei Zutreffen der Nullhypothese können wir nun
einen Hypothesentest für die einfaktorielle multivariate Varianzanalyse angeben.
:::{#thm-wilks-lambda-basierter-test-testumfangkontrolle-p-Wert}
## Wilks'-$\Lambda$-basierter Test, Testumfangkontrolle, p-Wert
Gegeben seien Modell der einfaktoriellen multivariaten Varianzanalyse und die
transfomierte Wilks'-$\Lambda$-Statistik $\tau$ mit Verteilungsparametern
$\nu_1,\nu_2$ wie oben definiert. Weiterhin sei für $\Upsilon = (\upsilon_1,...,\upsilon_n)$
der kritische Wert-basierte Test
\begin{equation}
\phi(\Upsilon) := 1_{\{\tau > k\}} :=
\begin{cases}
1 & \tau > k \\
0 & \tau \le k