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Strumenti per l’Open Science
Davide Massidda

Contento del corso

L’Open Science sta diventando il gold standard per la ricerca scientifica di alta qualità, favorendo la trasparenza e la riproducibilità dei risultati scientifici. Tuttavia, a molti ricercatori può mancare una adeguata formazione riguardo alle buone pratiche per rendere i propri risultati accessibili e riproducibili. Questo corso, caratterizzato da un taglio fortemente applicativo, si propone di colmare tali lacune presentando gli strumenti più moderni e appropriati per garantire la gestione e condivisione dei propri codici, dati e risultati.

Argomenti

  1. Coding prerequisites: uso del terminale e prerequisiti di programmazione.
  2. Open Science Framework: Condividere attraverso l’OSF per facilitare la libera collaborazione.
  3. Project organization: Organizzare il proprio progetto per favorire l’accessibilità e riproducibilità.
  4. Source code: Rifinire il codice sorgente per assicurare la comprensibilità delle analisi.
  5. Rights and licenses: Scegliere una licenza adeguata per un software "libero".
  6. Git and the version control: Gestire il proprio progetto attraverso un Version Control System.
  7. Pipeline and workflow: Creare una pipeline per strutturare un flusso di lavoro riproducibile.
  8. Work environment: Gestire le dipendenze software costruendo un ambiente di lavoro coerente.
  9. Container management: Gestione e uso di container con Docker per riprodurre delle analisi dei dati.

Requisiti software

Durante il corso saranno utilizzati i software elencati di seguito, che si consiglia di installare prima dell’inizio del corso.

Orari edizione 2022

Giorno Orario Aula (CLA)
Lunedì 20 giugno 9:00-13:00, 14:00-18:00 LAB 2A
Martedì 21 giugno 9:00-13:00, 14:00-18:00 LAB 3D
Mercoledì 22 giugno 14:00-18:00 LAB 3D